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    Fiber-seq技术:利用HiFi测序实现多组学检测

    why 631 2025-12-03 12:15:47 编辑

    来自华盛顿大学的研究团队开发了Fiber-seq 技术,顺利获得非特异性N6- 腺嘌呤甲基转移酶(m6A-MTase)将单个染色质纤维的结构 “标记” 在 DNA 模板上,结合PacBio HiFi测序,实现了 kilobase 级染色质纤维的核苷酸分辨率分析,该项研究成果于2020年发表于Science杂志。


    Fiber-seq 设计巧妙,其技术优势体现在:

    1)由于腺嘌呤在真核生物中几乎无内源性甲基化,且分布均匀(每2个碱基1个),避免 CpG/GpC 的“聚类”和“沙漠化”问题;
    2)实现单分子水平的染色质结构分析,而非群体平均值;
    3)结合 PacBio HiFi 测序,实现单个DNA分子多次重复测序,保证碱基识别准确性(包括修饰碱基);
    4)给予单倍型的检测结果;
    5)一次测序可以取得基因组信息,5mC CpG岛信息和染色质可及性信息,多维度挖掘基因组隐藏的价值;
    6)无需 bisulfite 转化,减少DNA 降解,结果重现性好。

    Fiber-seq检测染色质可及性原理

     
    Fiber-seq 与DNasel-seq和AdMTase-seq的结果比较,其标记分布与 DNase-seq结果高度一致。

    实验证明Fiber-seq可以应用于哺乳动物,昆虫和植物,拥有广泛的物种普遍性。未来随着PacBio HiFi测序读长和通量的提升,Fiber-seq有望成为解析全基因组单倍型调控,同时映射遗传序列和染色质状态的标准实验方法。

    PacBio将会参加8月21-25日在四川成都都江堰举办的2025表观遗传与染色质生物学大会。如您对HiFi测序和Fiber-seq感兴趣,欢迎您来PacBio展位(特2展位)研讨和咨询。

    关于PacBio

    PacBio (纳斯达克股票代码:PACB) 是一家领先的科学生命技术公司,致力于设计、开发和制造先进的测序解决方案,帮助科学家和临床研究人员解决复杂的遗传问题。我们的产品和技术源自两项高度差异化的核心技术,专注于准确性、质量和完整性,包括我们的HiFi长读长测序和我们的 SBB® 短读长测序技术。我们的产品为广泛的研究应用给予解决方案,包括人类生殖系测序、植物和动物科学、传染病和微生物学、肿瘤学和其他新兴应用。欲分析更多信息,请访问www.pacbio.cn。

    *PacBio 产品仅供研究使用,不用于临床诊断。


    关于怡美通德

    北京怡美通德科技开展有限公司创建于2003年,专业从事科学生命领域的仪器设备和试剂代理分销以及相关技术服务,多年来顺利获得与多个国际著名生物技术产品制造商的合作建立了完善的营销渠道与服务体系。我们是一家专注于科学生命领域的综合性方案给予商,致力于顺利获得代理分销高质量的科学生命产品和给予先进的生物技术服务,有助于科学生命研究和应用的开展。我们拥有一支专业、高效的团队,以及广泛的合作网络和资源,能够为客户给予全方位、一站式的解决方案。

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